Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRR29P0C7W0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRR29P0C7W0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRR29P0C7W0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRR29P0C7W0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms