Protein–RNA interactions for Protein: P0C672

TSPAN19, Putative tetraspanin-19, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN19P0C672 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN19P0C672 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN19P0C672 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSPAN19P0C672 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN19P0C672 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN19P0C672 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN19P0C672 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN19P0C672 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN19P0C672 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN19P0C672 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN19P0C672 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN19P0C672 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms