Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACAA1P09110 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACAA1P09110 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms