Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCB1P08183 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCB1P08183 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB1P08183 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms