Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMG1P04279 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms