Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHA1P01876 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHA1P01876 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms