Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F9P00740 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F9P00740 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
F9P00740 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
F9P00740 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F9P00740 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F9P00740 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F9P00740 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F9P00740 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F9P00740 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F9P00740 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F9P00740 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F9P00740 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F9P00740 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F9P00740 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F9P00740 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F9P00740 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F9P00740 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F9P00740 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
F9P00740 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F9P00740 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F9P00740 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F9P00740 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F9P00740 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F9P00740 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
F9P00740 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F9P00740 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F9P00740 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
F9P00740 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
F9P00740 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F9P00740 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F9P00740 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F9P00740 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F9P00740 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F9P00740 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F9P00740 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F9P00740 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
F9P00740 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F9P00740 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F9P00740 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F9P00740 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F9P00740 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F9P00740 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F9P00740 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F9P00740 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F9P00740 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F9P00740 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F9P00740 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
F9P00740 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F9P00740 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
F9P00740 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F9P00740 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F9P00740 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F9P00740 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F9P00740 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F9P00740 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F9P00740 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F9P00740 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F9P00740 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F9P00740 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F9P00740 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
F9P00740 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
F9P00740 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
F9P00740 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
F9P00740 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
F9P00740 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F9P00740 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
F9P00740 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F9P00740 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F9P00740 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F9P00740 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
F9P00740 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms