Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
F13A1P00488 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F13A1P00488 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F13A1P00488 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F13A1P00488 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F13A1P00488 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F13A1P00488 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
F13A1P00488 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
F13A1P00488 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F13A1P00488 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
F13A1P00488 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
F13A1P00488 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
F13A1P00488 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
F13A1P00488 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
F13A1P00488 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F13A1P00488 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F13A1P00488 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
F13A1P00488 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F13A1P00488 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
F13A1P00488 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F13A1P00488 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F13A1P00488 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
F13A1P00488 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F13A1P00488 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F13A1P00488 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F13A1P00488 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
F13A1P00488 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F13A1P00488 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F13A1P00488 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F13A1P00488 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
F13A1P00488 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
F13A1P00488 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
F13A1P00488 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
F13A1P00488 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F13A1P00488 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F13A1P00488 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F13A1P00488 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
F13A1P00488 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F13A1P00488 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F13A1P00488 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F13A1P00488 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
F13A1P00488 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F13A1P00488 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F13A1P00488 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F13A1P00488 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
F13A1P00488 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F13A1P00488 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
F13A1P00488 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
F13A1P00488 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F13A1P00488 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
F13A1P00488 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
F13A1P00488 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F13A1P00488 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F13A1P00488 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
F13A1P00488 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F13A1P00488 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F13A1P00488 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
F13A1P00488 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
F13A1P00488 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F13A1P00488 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F13A1P00488 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
F13A1P00488 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F13A1P00488 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F13A1P00488 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
F13A1P00488 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
F13A1P00488 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
F13A1P00488 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
F13A1P00488 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
F13A1P00488 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
F13A1P00488 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F13A1P00488 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
F13A1P00488 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F13A1P00488 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
F13A1P00488 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
F13A1P00488 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F13A1P00488 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
F13A1P00488 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
F13A1P00488 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
F13A1P00488 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
F13A1P00488 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
F13A1P00488 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F13A1P00488 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F13A1P00488 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F13A1P00488 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F13A1P00488 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
F13A1P00488 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F13A1P00488 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F13A1P00488 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
F13A1P00488 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F13A1P00488 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F13A1P00488 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
F13A1P00488 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms