Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL3O95573 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL3O95573 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL3O95573 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL3O95573 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms