Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDKL5O76039 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDKL5O76039 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDKL5O76039 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms