Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNFRSF21O75509 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF21O75509 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF21O75509 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms