Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUTAO60888 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUTAO60888 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CUTAO60888 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUTAO60888 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUTAO60888 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUTAO60888 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUTAO60888 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CUTAO60888 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUTAO60888 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUTAO60888 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CUTAO60888 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUTAO60888 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUTAO60888 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CUTAO60888 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUTAO60888 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUTAO60888 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUTAO60888 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CUTAO60888 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUTAO60888 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUTAO60888 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUTAO60888 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUTAO60888 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUTAO60888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUTAO60888 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUTAO60888 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CUTAO60888 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CUTAO60888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CUTAO60888 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CUTAO60888 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CUTAO60888 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUTAO60888 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CUTAO60888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUTAO60888 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUTAO60888 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUTAO60888 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUTAO60888 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUTAO60888 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CUTAO60888 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CUTAO60888 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CUTAO60888 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CUTAO60888 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CUTAO60888 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUTAO60888 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUTAO60888 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CUTAO60888 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUTAO60888 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUTAO60888 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CUTAO60888 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CUTAO60888 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUTAO60888 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUTAO60888 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUTAO60888 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUTAO60888 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUTAO60888 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CUTAO60888 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUTAO60888 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUTAO60888 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUTAO60888 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CUTAO60888 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUTAO60888 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CUTAO60888 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUTAO60888 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUTAO60888 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUTAO60888 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CUTAO60888 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUTAO60888 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUTAO60888 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUTAO60888 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CUTAO60888 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms