Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT7O43581 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT7O43581 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT7O43581 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT7O43581 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT7O43581 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT7O43581 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT7O43581 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT7O43581 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT7O43581 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT7O43581 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT7O43581 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT7O43581 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT7O43581 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT7O43581 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYT7O43581 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT7O43581 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT7O43581 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYT7O43581 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYT7O43581 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYT7O43581 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT7O43581 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT7O43581 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT7O43581 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT7O43581 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYT7O43581 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYT7O43581 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT7O43581 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT7O43581 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT7O43581 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT7O43581 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT7O43581 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT7O43581 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT7O43581 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT7O43581 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT7O43581 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SYT7O43581 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT7O43581 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT7O43581 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT7O43581 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT7O43581 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT7O43581 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT7O43581 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT7O43581 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT7O43581 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT7O43581 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT7O43581 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT7O43581 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT7O43581 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms