Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARPC5O15511 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARPC5O15511 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ARPC5O15511 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms