Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHUKO15111 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHUKO15111 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHUKO15111 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHUKO15111 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHUKO15111 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHUKO15111 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHUKO15111 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHUKO15111 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHUKO15111 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHUKO15111 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHUKO15111 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHUKO15111 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHUKO15111 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHUKO15111 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHUKO15111 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHUKO15111 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHUKO15111 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHUKO15111 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHUKO15111 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHUKO15111 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHUKO15111 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHUKO15111 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHUKO15111 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHUKO15111 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHUKO15111 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHUKO15111 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHUKO15111 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHUKO15111 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHUKO15111 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHUKO15111 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHUKO15111 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHUKO15111 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHUKO15111 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHUKO15111 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHUKO15111 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHUKO15111 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHUKO15111 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHUKO15111 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHUKO15111 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHUKO15111 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHUKO15111 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHUKO15111 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHUKO15111 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHUKO15111 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHUKO15111 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHUKO15111 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHUKO15111 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHUKO15111 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHUKO15111 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHUKO15111 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHUKO15111 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHUKO15111 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHUKO15111 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHUKO15111 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHUKO15111 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHUKO15111 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHUKO15111 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHUKO15111 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHUKO15111 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHUKO15111 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHUKO15111 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHUKO15111 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHUKO15111 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHUKO15111 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHUKO15111 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHUKO15111 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHUKO15111 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHUKO15111 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHUKO15111 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHUKO15111 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHUKO15111 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHUKO15111 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHUKO15111 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHUKO15111 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHUKO15111 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHUKO15111 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHUKO15111 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHUKO15111 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms