Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRPO00591 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRPO00591 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRPO00591 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRPO00591 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRPO00591 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRPO00591 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRPO00591 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRPO00591 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRPO00591 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRPO00591 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRPO00591 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRPO00591 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRPO00591 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRPO00591 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRPO00591 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRPO00591 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRPO00591 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRPO00591 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRPO00591 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GABRPO00591 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRPO00591 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRPO00591 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRPO00591 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRPO00591 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRPO00591 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRPO00591 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRPO00591 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRPO00591 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRPO00591 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRPO00591 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRPO00591 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRPO00591 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRPO00591 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRPO00591 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRPO00591 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRPO00591 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRPO00591 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRPO00591 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRPO00591 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRPO00591 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRPO00591 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRPO00591 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRPO00591 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRPO00591 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRPO00591 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRPO00591 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRPO00591 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRPO00591 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRPO00591 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRPO00591 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRPO00591 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRPO00591 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRPO00591 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRPO00591 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRPO00591 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRPO00591 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRPO00591 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRPO00591 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRPO00591 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRPO00591 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRPO00591 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRPO00591 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRPO00591 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRPO00591 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRPO00591 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRPO00591 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRPO00591 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRPO00591 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms