Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGPSO00116 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPSO00116 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPSO00116 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPSO00116 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPSO00116 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPSO00116 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGPSO00116 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGPSO00116 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGPSO00116 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGPSO00116 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPSO00116 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPSO00116 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPSO00116 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPSO00116 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPSO00116 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGPSO00116 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPSO00116 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPSO00116 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPSO00116 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPSO00116 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGPSO00116 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPSO00116 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPSO00116 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPSO00116 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPSO00116 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPSO00116 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGPSO00116 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPSO00116 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPSO00116 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPSO00116 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPSO00116 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPSO00116 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPSO00116 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGPSO00116 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGPSO00116 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGPSO00116 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGPSO00116 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGPSO00116 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AGPSO00116 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPSO00116 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPSO00116 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPSO00116 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AGPSO00116 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPSO00116 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPSO00116 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPSO00116 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPSO00116 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPSO00116 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AGPSO00116 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPSO00116 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPSO00116 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPSO00116 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPSO00116 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPSO00116 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPSO00116 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPSO00116 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AGPSO00116 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPSO00116 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPSO00116 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPSO00116 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPSO00116 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPSO00116 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AGPSO00116 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AGPSO00116 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPSO00116 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPSO00116 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPSO00116 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPSO00116 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPSO00116 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPSO00116 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPSO00116 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AGPSO00116 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
AGPSO00116 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPSO00116 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPSO00116 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPSO00116 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPSO00116 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AGPSO00116 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPSO00116 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPSO00116 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPSO00116 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPSO00116 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPSO00116 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPSO00116 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPSO00116 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AGPSO00116 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPSO00116 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPSO00116 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPSO00116 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPSO00116 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPSO00116 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms