Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP27XA6NNY8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP27XA6NNY8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP27XA6NNY8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms