Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC162PA2VCL2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC162PA2VCL2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC162PA2VCL2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms