Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HECTD4Q9Y4D8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HECTD4Q9Y4D8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms