Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COG6Q9Y2V7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG6Q9Y2V7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG6Q9Y2V7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COG6Q9Y2V7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG6Q9Y2V7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COG6Q9Y2V7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COG6Q9Y2V7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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