Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR1DQ9Y2S0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms