Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PADI1Q9ULC6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PADI1Q9ULC6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms