Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNOT11Q9UKZ1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNOT11Q9UKZ1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms