Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYTH4Q9UIA0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms