Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFMBT1Q9UHJ3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms