Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms