Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms