Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPS29Q9UBQ0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms