Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
XCL2Q9UBD3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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