Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVK-18Q9QC07 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms