Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC17A7Q9P2U7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC17A7Q9P2U7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC17A7Q9P2U7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms