Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms