Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THUMPD1Q9NXG2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms