Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT57Q9NWB7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms