Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASF1BQ9NVP2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms