Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms