Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNTG1Q9NSN8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNTG1Q9NSN8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms