Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA4BQ9NPR2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms