Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms