Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms