Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELL3Q9HB65 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms