Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NYXQ9GZU5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms