Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL11BQ9C0K0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms