Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP1Q9C000 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms