Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms