Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms