Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms