Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms