Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRIQ1Q96JM4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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